Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il1r1P13504 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms