Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms