Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb2P11835 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb2P11835 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms