Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtcP11725 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtcP11725 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtcP11725 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtcP11725 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtcP11725 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtcP11725 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtcP11725 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms