Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk1P11440 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk1P11440 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms