Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms