Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms