Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms