Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NefmP08553 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NefmP08553 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefmP08553 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefmP08553 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefmP08553 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefmP08553 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefmP08553 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefmP08553 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NefmP08553 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NefmP08553 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NefmP08553 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefmP08553 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms