Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col4a2P08122 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a2P08122 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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