Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr1P08046 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Egr1P08046 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms