Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp1P08042 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms