Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgamP05555 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgamP05555 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms