Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms