Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01680 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01680 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01680 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01680 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01680 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01680 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01680 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01680 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01680 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01680 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms