Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01655 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01655 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01655 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01655 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01655 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01655 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01655 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01655 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01655 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01655 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01655 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01655 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01655 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01655 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms