Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01638 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01638 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01638 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01638 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01638 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01638 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01638 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01638 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01638 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01638 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01638 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01638 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms