Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01635 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01635 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01635 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01635 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01635 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01635 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01635 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01635 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01635 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms