Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BlmO88700 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BlmO88700 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BlmO88700 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BlmO88700 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BlmO88700 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BlmO88700 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BlmO88700 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BlmO88700 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BlmO88700 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BlmO88700 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BlmO88700 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms