Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srpk1O70551 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srpk1O70551 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms