Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xirp1O70373 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xirp1O70373 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Xirp1O70373 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Xirp1O70373 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms