Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxq1O70220 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms