Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms