Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3cdO35904 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms