Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a2O35488 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms