Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edil3O35474 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Edil3O35474 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edil3O35474 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms