Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Atf6bO35451 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6bO35451 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atf6bO35451 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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