Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms