Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmiO35309 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NmiO35309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NmiO35309 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NmiO35309 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NmiO35309 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NmiO35309 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NmiO35309 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NmiO35309 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NmiO35309 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NmiO35309 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NmiO35309 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NmiO35309 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmiO35309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NmiO35309 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmiO35309 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NmiO35309 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NmiO35309 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms