Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncoa3O09000 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncoa3O09000 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms