Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NumblO08919 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NumblO08919 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NumblO08919 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NumblO08919 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NumblO08919 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NumblO08919 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NumblO08919 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NumblO08919 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NumblO08919 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NumblO08919 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms