Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn1O08788 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms