Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckarO08786 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckarO08786 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckarO08786 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckarO08786 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckarO08786 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms