Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3278L7N2D2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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