Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5458L7N219 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms