Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa3bJ9JI28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vwa3bJ9JI28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa3bJ9JI28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa3bJ9JI28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa3bJ9JI28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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