Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm17577J3QNF7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17577J3QNF7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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