Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm3727J3QM54 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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