Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms