Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm29394H3BIW7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms