Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5830473C10RikF8VQ07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms