Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28038F7BCN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28038F7BCN9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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