Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Crocc2F6XLV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms