Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4E9QAP7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms