Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lbE9Q9U0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lbE9Q9U0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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