Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FancfE9Q5Z5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FancfE9Q5Z5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FancfE9Q5Z5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FancfE9Q5Z5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FancfE9Q5Z5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FancfE9Q5Z5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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