Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BC005561E9Q5E2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms