Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Catsperg1E9Q355 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Catsperg1E9Q355 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms