Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Abcc4E9Q236 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Abcc4E9Q236 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms