Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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